怀孕期间不宜服用大豆异黄酮，因为大豆异黄酮本来就属于一种植物雌激素，孕期服用大豆异黄酮，会通过胎盘进入到胎儿的身体内，导致胎儿的发育受到了一定的影响，比如说男胎可能会出现女性化的现象，女胎就会出现阴道腺疾病。
1、青春期女性
青春期女性还处于生长发育的过程中，因此一般都不会出现雌激素缺少的现象，这个时候服用大豆异黄酮可能导致未成年女性出现性早熟的情况，影响正常发育。
2、孕期女性
因为大豆异黄酮中含有雌激素，孕妇使用含雌激素的产品后，会出现男胎女性化、女胎阴道腺病的可能。
3、哺乳期女性
哺乳期女性食用含雌激素的产品，分泌的乳汁让婴儿食用后会出现性早熟。
4、小叶增生患者
小叶增生的发病跟体内激素分泌变化和平时的情志有关，而大豆异黄酮含有植物雌激素，长期服用可能会与乳腺增生有关。
1、孕妇、哺乳期女性勿用(因相关安全性未知)
2、 儘管研究认为大豆异黄酮能降低乳癌事件及復发率(註8)，但有乳癌病史的女性，尤其是雌激素受体阳性(ER+)乳腺癌患者，最好别大量增加植物雌激素的摄入，包括大豆异黄酮
3、虽然部分研究认长期高剂量大豆异黄酮可能刺激子宫内膜增生，而子宫内膜增生可能与子宫内膜癌有关，但此论点目前仍未经证实。
4、 曾对黄豆製品过敏者勿用，可能产生过敏反应
5、 由于异黄酮代谢与肠道菌有关，因此抗生素疗程可能降低异黄酮的生物利用率
6、 勿与抗雌激素药物selective estrogen receptor modulators 併用，如tamoxifen(动物研究发现高剂量soy isoflavones可能干扰药物作用)
